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- -- BRAINGLOBE ATLAS --
- Generated on: 24/09/2020
- ------------------------------
- name: allen_mouse
- citation: Wang et al 2020, https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.04.007
- atlas_link: http://www.brain-map.org
- species: Mus musculus
- symmetric: True
- resolution: (50.0, 50.0, 50.0)
- orientation: asr
- version: 1.2
- shape: (264, 160, 228)
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- additional_references: []
- ------------------------------
- -- BRAIN STRUCTURES TREE --
- root (997)
- ├── VS (73)
- │ ├── AQ (140)
- │ ├── V3 (129)
- │ ├── V4 (145)
- │ │ └── V4r (153)
- │ ├── VL (81)
- │ │ ├── SEZ (98)
- │ │ └── chpl (108)
- │ └── c (164)
- ├── fiber tracts (1009)
- │ ├── cbf (960)
- │ │ ├── arb (728)
- │ │ ├── cbc (744)
- │ │ └── cbp (752)
- │ │ ├── icp (1123)
- │ │ │ └── sctd (553)
- │ │ ├── mcp (78)
- │ │ └── scp (326)
- │ │ ├── dscp (812)
- │ │ ├── sctv (866)
- │ │ └── uf (850)
- │ ├── cm (967)
- │ │ ├── IIIn (832)
- │ │ │ ├── mlf (62)
- │ │ │ └── pc (158)
- │ │ ├── IIn (848)
- │ │ │ ├── bsc (916)
- │ │ │ ├── csc (336)
- │ │ │ ├── och (117)
- │ │ │ └── opt (125)
- │ │ ├── IVn (911)
- │ │ ├── In (840)
- │ │ │ ├── aco (900)
- │ │ │ ├── lotg (21)
- │ │ │ │ ├── lot (665)
- │ │ │ │ └── lotd (538)
- │ │ │ └── onl (1016)
- │ │ ├── VIIIn (933)
- │ │ │ ├── cVIIIn (948)
- │ │ │ │ ├── bic (482)
- │ │ │ │ ├── cic (633)
- │ │ │ │ ├── das (506)
- │ │ │ │ ├── ll (658)
- │ │ │ │ └── tb (841)
- │ │ │ └── vVIIIn (413)
- │ │ ├── VIIn (798)
- │ │ │ └── gVIIn (1116)
- │ │ ├── Vn (901)
- │ │ │ ├── moV (93)
- │ │ │ └── sV (229)
- │ │ │ └── sptV (794)
- │ │ ├── Xn (917)
- │ │ │ └── ts (237)
- │ │ ├── drt (792)
- │ │ │ └── cett (932)
- │ │ │ ├── dc (514)
- │ │ │ │ └── cuf (380)
- │ │ │ └── ml (697)
- │ │ └── von (949)
- │ ├── eps (1000)
- │ │ ├── epsc (760)
- │ │ │ └── nst (102)
- │ │ ├── rust (863)
- │ │ │ └── vtd (397)
- │ │ └── tsp (877)
- │ │ ├── dtd (1060)
- │ │ ├── tspc (1043)
- │ │ └── tspd (1051)
- │ ├── lfbs (983)
- │ │ ├── cc (776)
- │ │ │ ├── ccb (484682516)
- │ │ │ ├── ccg (1108)
- │ │ │ ├── ccs (986)
- │ │ │ ├── ee (964)
- │ │ │ ├── fa (956)
- │ │ │ │ └── ec (579)
- │ │ │ └── fp (971)
- │ │ ├── cst (784)
- │ │ │ ├── cpd (924)
- │ │ │ ├── int (6)
- │ │ │ ├── py (190)
- │ │ │ └── pyd (198)
- │ │ └── lfbst (896)
- │ │ ├── ar (484682524)
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- │ ├── mfbs (991)
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- │ │ │ ├── act (908)
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- │ │ │ │ ├── fi (603)
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- │ │ │ │ │ └── mct (428)
- │ │ │ │ └── hc (618)
- │ │ │ │ ├── dhc (443)
- │ │ │ │ └── vhc (449)
- │ │ │ └── st (301)
- │ │ │ └── stc (484682528)
- │ │ └── mfsbshy (824)
- │ │ ├── mfb (54)
- │ │ ├── mfbse (1083)
- │ │ │ ├── fr (595)
- │ │ │ ├── hbc (611)
- │ │ │ └── sm (802)
- │ │ ├── mfbsma (46)
- │ │ │ ├── mp (673)
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- │ │ │ ├── mtt (690)
- │ │ │ └── pm (753)
- │ │ └── sup (349)
- │ └── scwm (484682512)
- └── grey (8)
- ├── BS (343)
- │ ├── HB (1065)
- │ │ ├── MY (354)
- │ │ │ ├── MY-mot (370)
- │ │ │ │ ├── ACVII (576)
- │ │ │ │ ├── AMB (135)
- │ │ │ │ │ ├── AMBd (939)
- │ │ │ │ │ └── AMBv (143)
- │ │ │ │ ├── DMX (839)
- │ │ │ │ ├── GRN (1048)
- │ │ │ │ ├── ICB (372)
- │ │ │ │ ├── IO (83)
- │ │ │ │ ├── IRN (136)
- │ │ │ │ ├── ISN (106)
- │ │ │ │ ├── LIN (203)
- │ │ │ │ ├── LRN (235)
- │ │ │ │ │ ├── LRNm (955)
- │ │ │ │ │ └── LRNp (963)
- │ │ │ │ ├── MARN (307)
- │ │ │ │ ├── MDRN (395)
- │ │ │ │ │ ├── MDRNd (1098)
- │ │ │ │ │ └── MDRNv (1107)
- │ │ │ │ ├── PARN (852)
- │ │ │ │ ├── PAS (859)
- │ │ │ │ ├── PGRN (938)
- │ │ │ │ │ ├── PGRNd (970)
- │ │ │ │ │ └── PGRNl (978)
- │ │ │ │ ├── PHY (154)
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- │ │ └── TH (549)
- │ │ ├── DORpm (856)
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- │ │ ├── GENd (1008)
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- │ │ │ │ ├── LGd-co (496345668)
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- │ │ │ └── MG (475)
- │ │ │ ├── MGd (1072)
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- │ │ ├── PP (1044)
- │ │ ├── SPA (609)
- │ │ ├── SPF (406)
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- │ │ └── VENT (637)
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- │ │ └── VPMpc (741)
- │ └── MB (313)
- │ ├── MBmot (323)
- │ │ ├── AT (231)
- │ │ ├── CUN (616)
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- │ │ ├── EW (975)
- │ │ ├── III (35)
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- │ │ ├── PAG (795)
- │ │ │ ├── INC (67)
- │ │ │ ├── ND (587)
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- │ │ │ └── Su3 (614454277)
- │ │ ├── PN (607344830)
- │ │ ├── PRT (1100)
- │ │ │ ├── APN (215)
- │ │ │ ├── MPT (531)
- │ │ │ ├── NOT (628)
- │ │ │ ├── NPC (634)
- │ │ │ ├── OP (706)
- │ │ │ ├── PPT (1061)
- │ │ │ └── RPF (549009203)
- │ │ ├── Pa4 (606826663)
- │ │ ├── RN (214)
- │ │ ├── RR (246)
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- │ │ └── CUL4, 5 (1091)
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- ├── CNU (623)
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- │ │ │ ├── BAC (287)
- │ │ │ └── BST (351)
- │ │ ├── PALd (818)
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- │ │ │ └── GPi (1031)
- │ │ ├── PALm (826)
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- │ │ └── SI (342)
- │ └── STR (477)
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- │ ├── STRd (485)
- │ │ └── CP (672)
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- │ │ └── OT (754)
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- │ ├── AAA (23)
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- │ ├── IA (1105)
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- └── CTX (688)
- ├── CTXpl (695)
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- │ │ ├── HIP (1080)
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- │ │ ├── ProS (484682470)
- │ │ └── SUB (502)
- │ ├── Isocortex (315)
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- │ │ ├── AI (95)
- │ │ │ ├── AId (104)
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- │ │ │ └── AIv (119)
- │ │ │ ├── AIv1 (704)
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- │ │ ├── ECT (895)
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- │ │ ├── GU (1057)
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- │ │ ├── ILA (44)
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- │ │ │ └── MOs (993)
- │ │ │ ├── MOs1 (656)
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- │ │ │ └── RSPv (886)
- │ │ │ ├── RSPv1 (542)
- │ │ │ ├── RSPv2/3 (430)
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- │ │ │ │ ├── SSp-un1 (182305693)
- │ │ │ │ ├── SSp-un2/3 (182305697)
- │ │ │ │ ├── SSp-un4 (182305701)
- │ │ │ │ ├── SSp-un5 (182305705)
- │ │ │ │ ├── SSp-un6a (182305709)
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- │ │ │ └── SSs (378)
- │ │ │ ├── SSs1 (873)
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- │ │ ├── VIS (669)
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- │ │ │ │ ├── VISal6a (601)
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- │ │ │ ├── VISam (394)
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- │ │ │ ├── VISl (409)
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- │ │ │ │ └── VISl6b (121)
- │ │ │ ├── VISli (312782574)
- │ │ │ │ ├── VISli1 (312782578)
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- │ │ │ │ ├── VISli6a (312782594)
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- │ │ │ ├── VISp (385)
- │ │ │ │ ├── VISp1 (593)
- │ │ │ │ ├── VISp2/3 (821)
- │ │ │ │ ├── VISp4 (721)
- │ │ │ │ ├── VISp5 (778)
- │ │ │ │ ├── VISp6a (33)
- │ │ │ │ └── VISp6b (305)
- │ │ │ ├── VISpl (425)
- │ │ │ │ ├── VISpl1 (750)
- │ │ │ │ ├── VISpl2/3 (269)
- │ │ │ │ ├── VISpl4 (869)
- │ │ │ │ ├── VISpl5 (902)
- │ │ │ │ ├── VISpl6a (377)
- │ │ │ │ └── VISpl6b (393)
- │ │ │ ├── VISpm (533)
- │ │ │ │ ├── VISpm1 (805)
- │ │ │ │ ├── VISpm2/3 (41)
- │ │ │ │ ├── VISpm4 (501)
- │ │ │ │ ├── VISpm5 (565)
- │ │ │ │ ├── VISpm6a (257)
- │ │ │ │ └── VISpm6b (469)
- │ │ │ └── VISpor (312782628)
- │ │ │ ├── VISpor1 (312782632)
- │ │ │ ├── VISpor2/3 (312782636)
- │ │ │ ├── VISpor4 (312782640)
- │ │ │ ├── VISpor5 (312782644)
- │ │ │ ├── VISpor6a (312782648)
- │ │ │ └── VISpor6b (312782652)
- │ │ └── VISC (677)
- │ │ ├── VISC1 (897)
- │ │ ├── VISC2/3 (1106)
- │ │ ├── VISC4 (1010)
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- │ │ ├── VISC6a (857)
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- │ └── OLF (698)
- │ ├── AOB (151)
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- │ │ └── AOBmi (204)
- │ ├── AON (159)
- │ ├── COA (631)
- │ │ ├── COAa (639)
- │ │ └── COAp (647)
- │ │ ├── COApl (655)
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- │ ├── DP (814)
- │ ├── MOB (507)
- │ ├── NLOT (619)
- │ │ ├── NLOT1 (260)
- │ │ ├── NLOT2 (268)
- │ │ └── NLOT3 (1139)
- │ ├── PAA (788)
- │ ├── PIR (961)
- │ ├── TR (566)
- │ └── TT (589)
- │ ├── TTd (597)
- │ └── TTv (605)
- └── CTXsp (703)
- ├── BLA (295)
- │ ├── BLAa (303)
- │ ├── BLAp (311)
- │ └── BLAv (451)
- ├── BMA (319)
- │ ├── BMAa (327)
- │ └── BMAp (334)
- ├── CLA (583)
- ├── EP (942)
- │ ├── EPd (952)
- │ └── EPv (966)
- ├── LA (131)
- └── PA (780)
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