Без опису

Kimberly Meechan 2e36bf26b2 separate mutation names into distinct columns for standardised data		2 місяців тому
.gitignore	769b041e8d Added gitignore for DSstore	3 місяців тому
README.md	d2987e9fd6 add a brief readme outlining test data types	3 місяців тому
pyrat-api-line-mutations-response.json	a51ac9e2d9 switch mutation order so we can check alphabetical sorting	2 місяців тому
pyrat-api-lines-response-1.json	7e0b7d8963 add mock responses for api lines call	2 місяців тому
pyrat-api-lines-response-2.json	7e0b7d8963 add mock responses for api lines call	2 місяців тому
pyrat-api-lines.csv	7e0b7d8963 add mock responses for api lines call	2 місяців тому
pyrat-api-multiple-response-and-parents-both-parents.json	3b7eed8428 updating files to join parents	2 місяців тому
pyrat-api-multiple-response-and-parents-offspring.json	6607045683 updated test data to include match asserts better	3 місяців тому
pyrat-api-multiple-response-multiple-parents.csv	9dc46d3c61 changed column names to fit new naming scheme	2 місяців тому
pyrat-api-multiple-responses-offspring.json	609d85dade fix typo in animalid	5 місяців тому
pyrat-api-multiple-responses-parents.json	68e393951d joined parents into one file	2 місяців тому
pyrat-api-multiple-responses.csv	6a833f2c20 removed err multiple parents	2 місяців тому
pyrat-api-no-parents-mutations-offspring.json	c8bc4ed8b6 add example with no listed mutations or parents	5 місяців тому
pyrat-api-no-parents-mutations.csv	77e740541e update to include new column naming scheme - test batch	2 місяців тому
pyrat-api-single-parent-mother.json	88dad25fe1 add example where all individuals are missing one parent	5 місяців тому
pyrat-api-single-parent-offspring.json	88dad25fe1 add example where all individuals are missing one parent	5 місяців тому
pyrat-api-single-parent.csv	77e740541e update to include new column naming scheme - test batch	2 місяців тому
pyrat-api-single-response-offspring.json	1acee0f65e add mock json responses for api requests	5 місяців тому
pyrat-api-single-response-parents.json	3b7eed8428 updating files to join parents	2 місяців тому
pyrat-api-single-response.csv	77e740541e update to include new column naming scheme - test batch	2 місяців тому
pyrat-data-2-mutations.csv	e730a1c2d1 update ID 17 so there's a mix of offspring genotypes	3 місяців тому
pyrat-data-3-mutations.csv	1cd9858c9d remove impossible offspring genotype for ID-014	3 місяців тому
pyrat-data-forbidden-genotypes.csv	5ecc096a12 remove forbidden scheme from forbidden-genotypes.csv	2 місяців тому
pyrat-data-forbidden-schemes.csv	128eedc090 fixed typo in forbidden	3 місяців тому
pyrat-data-mixed-mutations.csv	dcb29d0dd0 update column names	2 місяців тому
pyrat-data-single-mutation.csv	322cb3d778 update mother ids to be sequential in single mutation data	6 місяців тому
standardised-data-2-mutations.csv	2e36bf26b2 separate mutation names into distinct columns for standardised data	2 місяців тому
standardised-data-3-mutations.csv	2e36bf26b2 separate mutation names into distinct columns for standardised data	2 місяців тому
standardised-data-forbidden-genotypes.csv	2e36bf26b2 separate mutation names into distinct columns for standardised data	2 місяців тому
standardised-data-forbidden-schemes.csv	2e36bf26b2 separate mutation names into distinct columns for standardised data	2 місяців тому
standardised-data-single-mutation.csv	2e36bf26b2 separate mutation names into distinct columns for standardised data	2 місяців тому

oscar-test-data

Test data for OSCaR breeding scheme calculator.

All test data is fake, but matches the structure and edge cases of real data from a PyRAT server.

Types of test data

*.json: JSON files of raw PyRAT api responses
pyrat-api-*.csv: Expected csv files output by get_pyrat_data
pyrat-data-*.csv: Input csv files to standardise_pyrat_csv
standardised-data-*.csv: Expected output csv files from standardise_pyrat_csv

README.md

oscar-test-data

Types of test data