We use cookies to ensure you get the best experience on our website
Domů Procházet Nápověda News
Přihlásit se
neuroinformatics
/
oscar-test-data
6
0
Rozštěpit 0
Soubory Úkoly 0 Pull Requesty 0 Wiki

Bez popisu

Strom: 087c5f9a13
Větve Značky
oscar-test-d...
Henry Crosswell 087c5f9a13 excluding changes to forbidden genotype, moved to seperate branch před 1 měsícem
.gitignore 8c360ad2c0 resolve conflict by adding git ignore před 2 měsíci
README.md d2987e9fd6 add a brief readme outlining test data types před 3 měsíci
pyrat-api-line-mutations-response.json a51ac9e2d9 switch mutation order so we can check alphabetical sorting před 2 měsíci
pyrat-api-lines-response-1.json 7e0b7d8963 add mock responses for api lines call před 2 měsíci
pyrat-api-lines-response-2.json 7e0b7d8963 add mock responses for api lines call před 2 měsíci
pyrat-api-lines.csv 7e0b7d8963 add mock responses for api lines call před 2 měsíci
pyrat-api-multiple-response-and-parents-both-parents.json 3b7eed8428 updating files to join parents před 2 měsíci
pyrat-api-multiple-response-and-parents-offspring.json 6607045683 updated test data to include match asserts better před 3 měsíci
pyrat-api-multiple-response-multiple-parents.csv 9dc46d3c61 changed column names to fit new naming scheme před 2 měsíci
pyrat-api-multiple-responses-offspring.json 609d85dade fix typo in animalid před 5 měsíci
pyrat-api-multiple-responses-parents.json 68e393951d joined parents into one file před 2 měsíci
pyrat-api-multiple-responses.csv 6a833f2c20 removed err multiple parents před 2 měsíci
pyrat-api-no-parents-mutations-offspring.json c8bc4ed8b6 add example with no listed mutations or parents před 5 měsíci
pyrat-api-no-parents-mutations.csv 77e740541e update to include new column naming scheme - test batch před 2 měsíci
pyrat-api-single-parent-mother.json 6c1bf95ab1 rename a file for api changes před 2 měsíci
pyrat-api-single-parent-offspring.json 88dad25fe1 add example where all individuals are missing one parent před 5 měsíci
pyrat-api-single-parent.csv 77e740541e update to include new column naming scheme - test batch před 2 měsíci
pyrat-api-single-response-offspring.json 1acee0f65e add mock json responses for api requests před 5 měsíci
pyrat-api-single-response-parents.json 3b7eed8428 updating files to join parents před 2 měsíci
pyrat-api-single-response.csv 77e740541e update to include new column naming scheme - test batch před 2 měsíci
pyrat-data-1-mutation.csv e6c2b42f29 changed file name to fit naming convention před 2 měsíci
pyrat-data-2-mutations.csv e84a420e6a updated column names před 2 měsíci
pyrat-data-3-mutations.csv e84a420e6a updated column names před 2 měsíci
pyrat-data-forbidden-genotypes.csv 087c5f9a13 excluding changes to forbidden genotype, moved to seperate branch před 1 měsícem
pyrat-data-forbidden-parents.csv f1272f080d added more test data for impossible parents před 2 měsíci
pyrat-data-forbidden-schemes.csv a7b8c71c4a fix data to fit schemes před 2 měsíci
pyrat-data-multiple-parents-1-mutation.csv 1dd09328ec updated to add more edge cases před 2 měsíci
pyrat-data-multiple-parents-2-mutations.csv 7124b0dcf9 fix errors in data před 2 měsíci
pyrat-data-multiple-parents-3-mutations.csv cbe4272c77 fix errors in data před 2 měsíci
standardised-data-1-mutation.csv 14dc8462c1 changed names to fit convention před 2 měsíci
standardised-data-2-mutations.csv fe985943f3 reduced genotype column down to just one před 2 měsíci
standardised-data-3-mutations.csv fe985943f3 reduced genotype column down to just one před 2 měsíci
standardised-data-forbidden-genotypes.csv 087c5f9a13 excluding changes to forbidden genotype, moved to seperate branch před 1 měsícem
standardised-data-forbidden-parents.csv fe985943f3 reduced genotype column down to just one před 2 měsíci
standardised-data-forbidden-schemes.csv fe985943f3 reduced genotype column down to just one před 2 měsíci
standardised-data-multiple-parents-1-mutation.csv fe985943f3 reduced genotype column down to just one před 2 měsíci
standardised-data-multiple-parents-2-mutations.csv 915b84eca0 Revert "updated to fit test data and re-formatted" před 1 měsícem
standardised-data-multiple-parents-3-mutations.csv 915b84eca0 Revert "updated to fit test data and re-formatted" před 1 měsícem

README.md

oscar-test-data

Test data for OSCaR breeding scheme calculator.

All test data is fake, but matches the structure and edge cases of real data from a PyRAT server.

Types of test data

  • *.json: JSON files of raw PyRAT api responses
  • pyrat-api-*.csv: Expected csv files output by get_pyrat_data
  • pyrat-data-*.csv: Input csv files to standardise_pyrat_csv
  • standardised-data-*.csv: Expected output csv files from standardise_pyrat_csv